| Presidente | Rectoría | Dr. Oswaldo Chacón Rojas |
| Secretaria Permanente | Dirección General de Investigación y Posgrado | Dra. María Eugenia Culebro Mandujano |
| Integrante | Secretaría General | Dra. María del Carmen Vázquez Velasco |
| Integrante | Secretaría Académica | Dr. Florentino Pérez Pérez |
| Integrante | Oficina del Abogado General | Mtro. Rodolfo Guadalupe Lazos Balcázar |
| Integrante | Dirección General de Docencia y Servicios Escolares | Dr. Manuel Gustavo Ocampo Muñoa |
| Integrante | Secretaría Administrativa | Dra. María Concepción Ruiz Ruiz |
| Integrante | Dirección General de Planeación | Dr. Ignacio Macedo Castillejos |
| Integrante | Coordinación General de Relaciones Interinstitucionales | Dra. Rocío Moreno Vidal |
| UNIDAD ACADEMICA | VOCAL TITULAR | VIGENCIA |
| Facultad de Ciencias Agrícolas, Campus IV | MC. Jorge Reyes Reyes | 28 de febrero 2025 al 27 de febrero 2027 |
| Facultad de Ciencias Agronómicas, Campus V | Dr. René Pinto Ruíz | 14 de marzo de 2025 al 13 de marzo de 2027 |
| Centro de Investigación de los Sistemas Costeros y Continentales |
Dr. Edgar Tovar Juárez | 06 de mayo de 2025 al 05 de mayo de 2027 |
| Facultad de Estudios Multidisciplinarios, Campus Comitán | Mtra. Rocío Flores Flores | 25 de junio de 2025al 24 de junio de 2027 |
| Escuela de Contaduría y Administración, Campus VII | Mtro. Gerardo Sanony Wade Aguilar | 19 de febrero de 2025 al 18 de febrero 2027 |
| Escuela de Ciencias Administrativas Istmo-costa, Campus IX Tonalá | Dr. Élfigo Mazariegos Roblero | 24 de marzo 2026 al 23 de marzo de 2028 |
| Escuela de Ciencias Administrativas, Campus IX | Dra. Ligia Margarita Domínguez Castañón | 02 de junio 2025 al 01 de junio 2027 |
| Facultad de Lenguas, Campus Tuxtla | Mtra. Guadalupe Díaz Jiménez | 14 de agosto 2024 al 13 de agosto 2026 |
| Escuela de Lenguas, Campus Tapachula | Dra. Angélica Patricia Córdoba Meza | 18 de junio de 2025 al 17 de junio de 2027 |
| Facultad de Ingeniería, Campus I | Dra. Delva del Rocío Guichard Romero | 28 de abril 2025 al 27 de abril 2027 |
| Facultad de Arquitectura, Campus I | Mtro. José Luis Jiménez Albores | 18 de septiembre 2025 al 17 de septiembre 2027 |
| Facultad de Ciencias Sociales, Campus III | Dra. Cecilia Alba Villalobos | 11 de septiembre 2025 al 2025 al 10 de septiembre 2027 |
| Escuela de Humanidades, Campus IV | Dra. Ana Luisa Zapata Algarin |
05 de septiembre 2025 al 04 de septiembre 2027 |
| Escuela de Humanidades, Campus IX | Dr. Ernesto Pérez Elizondo | 06 de junio 2025 al 05 de junio 2027 |
| Facultad de Ciencias en Física y Matemáticas | Dr. Víctor Iván Ruíz Pérez | 05 de agosto 2024 al 04 de agosto 2026 |
| Instituto de Biociencias (IBC) | Dr. Isidro Ovando Medina | 10 de abril 2025 al 09 de abril 2027 |
| Facultad de Derecho, Campus III | Dra. Elizabeth Consuelo Ruíz Sánchez | 21 de febrero 2025 al 20 de febrero 2027 |
| Instituto de Investigaciones Jurídicas | Dra. Corina Giacomello | 07 de abril 2025 al 06 de abril 2027 |
| Centro de Estudios para el Desarrollo Municipal y Políticas Públicas (CEDES) | Dr. Marco Antonio Lara Martínez |
15 de enero de 2025 al 14 de enero de 2027 |
| Escuela de Sistemas Alimentarios (SIAL) | Dra. Julieta Grajales Conesa |
08 de septiembre 2025 al 07 de septiembre 2027 |