| Presidente | Rectoría | Dr. Oswaldo Chacón Rojas |
| Secretaria Permanente | Dirección General de Investigación y Posgrado | Dra. María Eugenia Culebro Mandujano |
| Integrante | Secretaría General | Dra. María del Carmen Vázquez Velasco |
| Integrante | Secretaría Académica | Dr. Florentino Pérez Pérez |
| Integrante | Oficina del Abogado General | Mtro. Rodolfo Guadalupe Lazos Balcázar |
| Integrante | Dirección General de Docencia y Servicios Escolares | Dr. Manuel Gustavo Ocampo Muñoa |
| Integrante | Secretaría Administrativa | Dra. María Concepción Ruiz Ruiz |
| Integrante | Dirección General de Planeación | Dr. Ignacio Macedo Castillejos |
| Integrante | Coordinación General de Relaciones Interinstitucionales | Dra. Rocío Moreno Vidal |
| UNIDAD ACADEMICA | VOCAL TITULAR | VIGENCIA |
| Facultad de Ciencias Agrícolas, Campus IV | MC. Jorge Reyes Reyes | 28 de febrero 2025 al 27 de febrero 2027 |
| Facultad de Ciencias Agronómicas, Campus V | Dr. René Pinto Ruíz | 14 de marzo de 2025 al 13 de marzo de 2027 |
| Centro de Investigación de los Sistemas Costeros y Continentales |
Dr. Edgar Tovar Juárez | 06 de mayo de 2025 al 05 de mayo de 2027 |
| Facultad de Estudios Multidisciplinarios, Campus Comitán | Mtra. Rocío Flores Flores | 25 de junio de 2025al 24 de junio de 2027 |
| Escuela de Contaduría y Administración, Campus VII | Mtro. Gerardo Sanony Wade Aguilar | 19 de febrero de 2025 al 18 de febrero 2027 |
| Escuela de Ciencias Administrativas Istmo-costa, Campus IX Tonalá | Dr. Élfigo Mazariegos Roblero | 24 de marzo 2026 al 23 de marzo de 2028 |
| Escuela de Ciencias Administrativas, Campus IX | Dra. Ligia Margarita Domínguez Castañón | 02 de junio 2025 al 01 de junio 2027 |
| Facultad de Lenguas, Campus Tuxtla | Mtra. Guadalupe Díaz Jiménez | 14 de agosto 2024 al 13 de agosto 2026 |
| Escuela de Lenguas, Campus Tapachula | Dra. Angélica Patricia Córdoba Meza | 18 de junio de 2025 al 17 de junio de 2027 |
| Facultad de Ingeniería, Campus I | Dra. Delva del Rocío Guichard Romero | 28 de abril 2025 al 27 de abril 2027 |
| Facultad de Arquitectura, Campus I | Mtro. José Luis Jiménez Albores | 18 de septiembre 2025 al 17 de septiembre 2027 |
| Facultad de Ciencias Sociales, Campus III | Dra. Cecilia Alba Villalobos | 11 de septiembre 2025 al 2025 al 10 de septiembre 2027 |
| Escuela de Humanidades, Campus IV | Dra. Ana Luisa Zapata Algarin |
05 de septiembre 2025 al 04 de septiembre 2027 |
| Escuela de Humanidades, Campus IX | Dr. Ernesto Pérez Elizondo | 06 de junio 2025 al 05 de junio 2027 |
| Facultad de Ciencias en Física y Matemáticas | Dr. Víctor Iván Ruíz Pérez | 05 de agosto 2024 al 04 de agosto 2026 |
| Instituto de Biociencias (IBC) | Dr. Isidro Ovando Medina | 10 de abril 2025 al 09 de abril 2027 |
| Facultad de Derecho, Campus III | Dra. Elizabeth Consuelo Ruíz Sánchez | 21 de febrero 2025 al 20 de febrero 2027 |
| Instituto de Investigaciones Jurídicas | Dra. Corina Giacomello | 07 de abril 2025 al 06 de abril 2027 |
| Centro de Estudios para el Desarrollo Municipal y Políticas Públicas (CEDES) | Dr. Marco Antonio Lara Martínez |
15 de enero de 2025 al 14 de enero de 2027 |
| Escuela de Sistemas Alimentarios (SIAL) | Dra. Julieta Grajales Conesa |
08 de septiembre 2025 al 07 de septiembre 2027 |
COMISIÓN DE INVESTIGACIÓN
Dra. Alma Leslie León Ayala
Dra. Ligia Margarita Domínguez Castañón
Dra. Consuelo Esthervina Corzo Domínguez
Dr. Ernesto Pérez Elizondo
Dra. Elizabeth Consuelo Ruiz Sánchez
COMISIÓN DE ESTUDIOS DE POSGRADO
Dr. René Pinto Ruíz
Mtra. Guadalupe Díaz Jiménez
Mtro. Gerardo Sanony Wade Aguilar
Dra. Isabel Pérez Pérez
Dra. Delva del Rocio Guichard Romero